O hospital, ianugurado em maio de 2020, gerido pelo Centro de Excelência em Políticas Públicas – CEPP inicialmente funciona como polo de atendimento aos casos mais graves de infecção da COVID19, que são encaminhados pelas unidades de saúde básicas e dos polos de atendimento montados no Centro, em Ponta Negra e Itaipuaçu. O Che Guevara tem capacidade para 137 leitos, entre eles, enfermarias clínicas, de urgência e emergência, infantis, adultas e de idosos, além de contar com um tanque de oxigênio de 11 mil litros para abastecer toda a unidade e um estacionamento com capacidade para 238 vagas.
O hospital foi aberto com 75 leitos, 20 deles de UTI, 5 de trauma, 10 de suporte e 40 de enfermarias. O CTI da unidade foi contemplado com um aparelho de raio-x digital, capaz de realizar o exame no local, sem a necessidade do deslocamento do paciente.